2011年，地区文物局、吐鲁番学研究院将继续与中国社会科学院考古研究所、龟兹石窟研究院合作，进一步对吐峪沟石窟寺进行科学的考古发掘工作。目前，各项筹备工作已就绪，发掘清理工作于4月初开始，5月中旬结束，计划发掘面积500平方米。
吐峪沟石窟寺遗址考古发掘被列为“2010年中国六大考古新发现”，是地区文博系统全面贯彻落实地委扩大会议精神，践行“重文”发展战略的具体体现，必将对提升吐鲁番国际知名度，增强吐鲁番发展的“软实力”，促进吐鲁番文物事业的转型升级和跨越发展起到重要的助推作用。（新疆吐鲁番地区文物局）